治療生殖器皰疹一般採用全身性抗病毒治療結合區域性傷口處理,以加快康復速度。全身性抗病毒治療主要透過口服抗病毒藥物進行,例如阿昔洛韋、伐昔洛韋或泛昔洛韋。具體的療程和劑量應按醫囑執行。如果症狀明顯,可以口服阿司匹林、布洛芬等藥物緩解疼痛。區域性治療包括使用生理鹽水、洗必泰溶液或硼酸溶液清洗傷口,合併使用抗生素和抗真菌藥物可以治療繼發的細菌或真菌感染。外用抗病毒藥物,如阿昔洛韋乳膏或噴昔洛韋乳膏,也能促進皰疹創面的癒合。
經過治療後,初發生殖器皰疹患者的全身症狀會消失,皮損也會逐漸消退,達到臨床治癒的狀態。大部分患者通常需要三週左右的時間來達到這個效果。但是,生殖器皰疹容易復發,尤其是在初次感染後的一年內,復發的頻率較高。單純皰疹2型感染比1型感染更容易復發。平時應注意避免飲酒、辛辣刺激食物、疲勞、感冒、焦慮和緊張等因素,因為這些因素是復發的重要誘發因素。因此,平時注意預防這些因素有助於減少復發次數。