引起生殖器皰疹的病毒主要包括單純皰疹病毒Ⅰ型和單純皰疹病毒Ⅱ型。單純皰疹病毒Ⅰ型是導致口脣部皰疹的主要原因,而口交行為是生殖器皰疹的常見誘因之一。
在肛門生殖器皰疹中,單純皰疹病毒Ⅰ型的感染力較之前有所增加,在男男同性戀和女女同性戀者中更為普遍。單純皰疹病毒Ⅱ型是導致生殖器皰疹發作最常見且最主要的原因,亞臨床症狀及無症狀時期間歇性的排毒就是其主要病因。目前,生殖器皰疹Ⅰ型和Ⅱ型都可能導致患者病情反覆發作,但在Ⅱ型皰疹病毒中,病情復發更為常見。因此,對皰疹病毒的亞型分析有助於評估患者的病情和預測預後。
目前有兩種方法用於皰疹病毒的檢測。一種是病毒學檢測,透過對患處的組織和細胞進行培養來進行檢測,但是由於其檢測率的靈敏度較低,臨床上常採用聚合酶鏈式反應即PCR反應。由於生殖器皰疹的排毒是間歇性的,因此PCR檢測結果陰性並不能排除皰疹病毒的感染。另一種是血清學檢測,透過檢測皰疹病毒的抗體來進行檢測,主要用於監測臨床上無症狀的HSV感染。