首先是頸椎病情況。透過磁共振檢查可以獲取更詳細的資訊,不僅可以檢測椎間盤是否突出、骨質是否增生、是否有頸椎病等,還可以觀察脊髓是否發生病變、是否存在脊髓空洞、脊髓是否有變性、是否存在脊髓腫瘤,另外還可以評估椎管的情況。因此,一般來說,對於頸椎、腰椎的檢查,磁共振是較好的選擇。此外,對於整個頭顱腦部的檢查,通常會先進行常規CT篩查,如果發現了異常病變,再進一步進行磁共振檢查。磁共振檢查在急性腦梗塞的診斷方面尤其擅長,特別是超急性腦梗塞,磁共振檢查具有明顯的優勢。
其次是關節的檢查,例如半月板、膝關節和肩關節等。CT無法替代磁共振,必須使用磁共振來進行檢查。另外,磁共振檢查也在子宮附件類(包括前列腺)方面具有比CT更好的優勢。當然,CT在這方面也具有一定的優勢,但與磁共振相比,磁共振更加適用、更為優越。