複雜黴菌性陰道炎是指患者在治療期內復發次數或症狀加重情況較多。目前，根據疾病的病情分化，可以將其分為三種型別：
1.重度黴菌性陰道炎
治療方案：採用長療程的區域性或口服藥物方案，例如：咪康唑栓400mg，每6天使用一次為一療程，或者克黴唑栓500mg，第一天和第四天使用陰道藥，又或者使用氟康唑150mg，第一天和第四天口服。
2.複發性黴菌性陰道炎
指一年內出現了至少四次及以上的黴菌性陰道炎發作。對於複發性黴菌性陰道炎的治療，需要進行加強和鞏固的治療。強化治療包括咪康唑酸1200mg、克黴唑栓500mg和氟康唑150mg，在第一天、第四天和第七天使用陰道藥或口服藥。鞏固治療是在每月規律的發作時間前進行預防性使用藥物，每次使用藥物持續6個月。對於無規律性的症狀，採用每週陰道用藥1次預防感染，也需要持續使用6個月。
3.非白假絲酵母菌感染的黴菌性陰道炎
這種型別的黴菌性陰道炎需要採用非氟康唑類的藥物進行治療，目前推薦使用的是600mg硼酸膠囊，每天陰道用藥1次，共2周。
綜上所述，對於複雜性的黴菌性陰道炎，治療原則是進行抗真菌治療，如果想要根治，強化治療和鞏固治療是非常必要的，至少需要連續使用6個月的藥物。透過正規的診療和全面的治療，大多數患者都可以順利治癒。