1、腸道寄生蟲：蛔蟲寄生在嬰兒小腸內，不僅會掠奪營養物質，還會刺激腸壁，分泌毒素，從而引起消化不良。嬰兒經常感到隱隱作痛的肚子會導致失眠、煩躁和夜間磨牙。另外，蟯蟲也會引起磨牙。蟯蟲通常寄生在人體大腸內，在嬰兒入睡後，蟯蟲會悄悄爬到肛門處產卵，引發肛門瘙癢，使嬰兒睡得不安穩，進而出現磨牙現象。
2、晚餐過飽或睡前加餐：這樣不僅影響營養素的吸收，還會增加胃腸的負擔。因為在入睡時，胃腸道可能還殘留大量未消化的食物，整個消化系統不得不連續工作，甚至咀嚼肌也會被動員起來，不由自主地收縮，引發磨牙。
3、維生素D缺乏：由於體內鈣、磷代謝紊亂，會導致骨骼脫鈣、肌肉痠痛和植物神經紊亂，通常會出現多汗、夜驚、焦躁和夜間磨牙。
4、精神緊張或興奮：有一些嬰兒通常不會磨牙，但如果在臨睡前聽了緊張刺激的故事，或者剛看完恐怖、緊張的電視或動畫片，由於神經系統過於興奮，也可能出現夜間磨牙。另一箇原因可能是壓力太大，如無法適應幼兒園生活、害怕班裡的某個小朋友、與父母或家人爭吵等，都會導致嬰兒精神緊張，進而晚上磨牙。此外，一些活躍度過高的嬰兒也可能出現夜間磨牙。
5、牙齒問題：牙齒排列不齊、咀嚼肌用力過大或長期片面咀嚼，以及牙齒咬合不良，可能導致顳下頜關節功能紊亂，進而引發夜間磨牙。此外，牙齒排列不整齊的嬰兒，咀嚼肌的位置通常也不正常，在晚上睡覺時，咀嚼肌可能會無意識地收縮，導致磨牙。
6、睡姿不良：如果嬰兒睡覺時經常偏向一側，會造成咀嚼肌不協調，使受壓一側的咀嚼肌異常收縮，從而出現磨牙。嬰兒晚上蒙著頭睡覺，二氧化碳過度積聚，氧氣供應不足，也可能引發磨牙。