針對不同胃病的需求和藥物作用機理的特點，選擇合適的用藥時間是治療胃病的關鍵，只有這樣才能達到最佳療效。
在飯前，可以服用多潘立酮(嗎丁啉)、甲氧氯普胺(胃復安)及西沙必利等藥物。它們具有增強胃腸道蠕動、促進胃內食物消化以及協調食管、胃和十二指腸運動的功能。對於噁心、嘔吐、胃酸倒流、噯氣和飯後脹悶等症狀有良好的療效。這些藥物應該在飯前半小時服用，以便在進食時藥效達到高峰，從而確保在藥物的作用下整個上消化道正常運作。
飯後可以服用一些鹼性藥物，比如氧化鎂、氫氧化鎂、三矽酸鎂等，主要起到中和胃酸的作用。這些藥物應該在飯後1-3小時服用，但不應長期服用，否則可能導致鎂中毒。腎功能不全的患者應禁用這些藥物。
飯間服藥指的是兩餐之間服用藥物。慢性胃炎和慢性胃潰瘍患者常常使用硫糖鋁(胃潰寧)、米索前列醇(喜克潰)或麥滋林―S顆粒等藥物來保護胃粘膜。近年來，發現隱藏在胃粘膜中的幽門螺桿菌與慢性胃炎有密切關係，因此醫生會使用含有膠體枸櫞酸鉍、迪樂等藥物來進行治療。由於這些藥物需要直接接觸胃粘膜才能發揮作用，所以最好在兩餐之間服用。
睡前服藥，比如西咪替丁(甲氰咪胍、泰胃美)、雷尼替丁、法莫替丁及奧美拉唑(洛賽克)等抗酸藥物，可以強力抑制胃酸分泌。這些藥物不僅可以緩解潰瘍或胃粘膜糜爛引起的疼痛，促使潰瘍癒合，還可以治療潰瘍病或胃粘膜糜爛引起的上消化道出血。在疾病急性期，一般建議早晚各服一次，等到病情緩解後，就可以改為晚上服用維持量。