相對於64排螺旋CT而言,16排CT的掃描速度較慢,球管質量(即陽極熱容量)相對較低,解析度也較低。總體而言,16排CT的效能較64排CT落後。然而,隨著技術的進步和裝置廠商的不斷改進,原本只用於64排CT的技術(如迭代演算法)如今也廣泛應用於16排CT機,從而大大降低了輻射劑量並提高了影象的解析度。
此外,16排CT的球管質量(即陽極熱容量)普遍提高,避免了檢查中途停止的情況發生。因此,除了在心血管檢查方面表現較差外,16排螺旋CT完全能夠滿足臨床對其他系統CT檢查的要求,不會影響大多數病變。此外,16排CT機的價格幾乎是64排CT的一半,更有利於基層CT裝置的推廣。因此,儘管相對落後,這種機型在經濟和實用性方面具有較高的價效比。