治療腦梗塞常使用的藥物有很多種,其中注射液是主要的治療方式。注射液包括阿替普酶、尿激酶、依達拉奉、胞二磷膽鹼、腦蛋白水解物、706代血漿、丁苯酞、降纖酶和安克洛酶等。阿替普酶和尿激酶主要用於溶解栓子,起到溶栓作用。而依達拉奉、胞二磷膽鹼和腦蛋白水解物主要用於神經保護治療。舒血寧、維腦路通和川芎嗪則主要用於改善血液迴圈和治療活血化瘀。丁苯酞則可以改善患者神經功能缺損的症狀和體徵,706代血漿主要用於擴容。
當患者出現意識障礙時,通常可以使用醒腦靜進行治療,其主要作用是恢復患者意識。如果患者出現顱內壓增高的情況,則可以透過甘露醇靜脈滴注來降低顱內壓,也可以使用甘油果糖和速尿進行治療。對於腦梗塞患者,也可以同時進行降纖治療,主要使用的藥物有降纖酶和安克洛酶。