軟組織感染是較為常見的表淺感染,與深部組織感染的鑑別是其首要問題。其與急性血源性骨髓炎的鑑別也比較常見。相比較於全身症狀輕微,甚至沒有發熱,軟組織炎症的區域性表現則相當嚴重,呈現紅腫熱痛的症狀,且壓痛比較淺。而血源性骨髓炎是一種由骨骼引起感染的疾病,骨骼較為深層,疼痛點主要在長管狀骨的幹骺端,即長骨的兩端,如大腿骨、小腿骨。壓痛的特點是圓柱形的深部壓痛及環周壓痛。在對患肢的4個平面(前後左右)進行深部壓痛檢查時,皆會感受到疼痛。相比之下,軟組織感染髮生在肢體的一側,在骨頭處於一側,壓痛之前只侷限在1個或2個平面,故對鑑別診斷十分重要。
另一箇需要鑑別的是腫瘤性的潰瘍,該潰瘍是由於腫瘤潰爛所致,並且常常帶有外觀發紅的特點,容易誤認為是感染,該疾病多因身體表淺部位或面板惡性腫瘤引起,如面板癌或乳腺癌等,晚期癌症都容易觸及潰瘍且產生分泌物。潰瘍的特點是邊緣比較硬、凸出,整體外形呈菜花狀,分泌物為血性,不像感染的分泌物是膿性的,具有半惡臭性質。注意,腫瘤也常伴隨淋巴結轉移,例如乳腺癌常會引起腋窩淋巴結轉移。最終確診的依據則需要進行病理組織檢查。