宮頸原位癌的治療是根據患者的個人意願、年齡、生育要求、依從性、隨訪條件、就診醫院裝置和技術等因素來決定的。目前，大部分學者認為宮頸原位癌的治療主要以切除性手術為主，可以選擇宮頸錐切或者子宮全切。
對於宮頸原位癌的治療，宮頸錐切是首選方法。宮頸錐切一般在月經乾淨之後的3-7天進行，既可以作為診斷手段，又是一種有效的治療方法。在進行宮頸錐切後，如果病理檢查結果顯示為原位癌，可以進行隨診或者在4-6周後進行子宮切除手術。如果病理結果顯示為浸潤癌，則需要根據具體情況及早採取有效的治療措施。常用的宮頸錐切方法有冷刀錐切、鐳射錐切和利普刀錐切術，術後可能出現出血、感染、頸管狹窄以及宮頸機能不全等併發症，對懷孕可能稍有影響。
另一種治療宮頸原位癌的方法是子宮全切。子宮切除術是切除包括宮頸在內的整個子宮，對於沒有生育要求的宮頸原位癌患者，可以選擇接受全子宮切除。子宮切除術可以直接進行，也可以在宮頸錐切術後進行，一般推薦後者。如果選擇直接手術，進行詳細的陰道鏡評估非常重要。關於是否需要切除陰道存在爭論，目前多數學者認為原則上應該進行筋膜外子宮切除。由於大約2%-3%的宮頸原位癌病變會累及到陰道穹窿，所以陰道切除應至少0.5cm。如果病變累及到陰道，應擴大切除範圍。