阿托品主要適用於兒童進行散瞳、驗光和虹膜睫狀體炎的散瞳。阿托品能夠阻斷乙醯膽鹼的作用，使瞳孔括約肌和睫狀肌麻痺，從而引起瞳孔的擴大，其作用可持續10-12天。但是，兒童對這些藥物往往會導致中毒反應，如面色潮紅和心率加快。阿托品是一種從巔茄等植物中提取的副交感神經藥物，它能夠降低並解除交感神經對肌肉和腺體的控制，而睫狀肌的收縮能夠調節晶體的形狀，使人能夠看清遠處和近處的物體。一般來說，假性近視是由於長時間的睫狀肌痙攣無法放鬆所致，因此在這種情況下可以使用阿托品滴眼，以緩解假性近視和治療真性近視。然而，由於阿托品存在一定的副作用，長期使用較為困難，因此阿托品仍然只能起到預防近視的作用，而非治療。在停用阿托品後，近視眼加深仍然會繼續進行。
此外，阿托品屬於m膽鹼受體拮抗劑，其主要作用是解除胃腸道平滑肌的痙攣、擴大瞳孔、抑制腺體分泌。此外，它還可以作用於血管和平滑肌，擴張血管、改善微迴圈，並能夠興奮或抑制中樞神經系統。阿托品主要還用於大劑量使用，以解除有機磷中毒的症狀。由於阿托品對胃腸道平滑肌的解除痙攣作用，當出現膽囊結石伴有膽絞痛或出現輸尿管結石時，可以口服或肌肉注射阿托品，以減輕絞痛症狀。在手術之前使用阿托品，可以抑制唾液腺分泌，以防止手術中腺體分泌過多，引起誤吸。