布加綜合徵是一種進行性損害性疾病,患者很難痊癒,並且其預後較差。其自然病程主要取決於多箇因素,包括疾病的嚴重程度、病變部位和性質、病變範圍,以及機體的代償情況。
一般來說,若肝段下腔靜脈阻塞主導病程,則病情持續的時間相對較長;而若以肝靜脈為主,則病程較短。有些患者會出現急性發作,病程更為短暫。在一些情況下,嚴重症狀可能在短時間內迅速出現,導致肝硬化、肝淤血、肝昏迷、肝腎綜合徵、感染以及合併肝癌等併發症的發生,進而導致患者的死亡。因此,非手術治療對於布加綜合徵的療效並不理想,其死亡率高達100%。