對於典型的胃癌而言,在胃鏡檢查中可以作出初步判斷。胃癌的最終確診主要依靠電子胃鏡和病理檢查。在正常的電子胃鏡下,大部分胃癌可以明確診斷,如潰瘍型胃癌或有明顯病變呈結節樣增生的病灶。然而,對於部分微小病變或分化程度不明確的病灶,僅憑經驗很難做出判斷,此時需要等待病理結果的出具。有些胃癌型別,如皮革樣胃癌,在初次病理檢查中無法明確診斷,甚至有些患者需要進行多次病理檢查後方能確定,個別患者甚至需要在手術後才能明確診斷。
如果胃鏡檢查發現腫物的生長情況,且鏡下高度懷疑為胃癌,但尚不能完全確診,例如腫物表面有糜爛、邊緣不規整、潰瘍底部汙穢、出血、高低不平,以及顏色發灰或與周圍黏膜之間分界不清、胃壁僵硬、胃蠕動減慢或消失、胃壁增厚等表現,在這些情況下可以在胃鏡檢查時採取取病變部位黏膜活檢的方式進行病理學證實,以獲得100%的胃癌確診。