亞甲炎的臨床症狀主要表現為早期起病迅速,患者會出現發熱,同時伴有寒戰、疲乏、無力和食慾不振等感覺。最為典型的特徵是甲狀腺部位的疼痛和壓痛,這種疼痛常放射到頜下、耳後或頸部等區域,尤其在咀嚼和吞嚥時疼痛更加明顯。甲狀腺病變範圍因個體差異而不一,可能從單側開始,擴大至另一側,或始終侷限在一箇側葉。患者的甲狀腺會腫大且硬實,有明顯的壓痛感。
當病變範圍較大時,甲狀腺內的甲狀腺激素和非激素碘化蛋白會暫時性地大量釋放入血液,導致除了與感染有關的一般表現外,還可能出現甲狀腺功能亢進的常見症狀。然而,進入後期時,由於病變破壞導致甲狀腺內的甲狀腺激素耗竭,同時甲狀腺實質細胞尚未完全修復,血液中的甲狀腺激素濃度可能降至甲狀腺功能減退水平,患者在臨床上也可能出現甲狀腺功能減退的症狀。