朗格漢斯細胞組織細胞增生症是一種可以呈現局灶性或全身性變化的疾病。其起病方式可能是急性的，也可能是緩慢的，病程可短至數週或長達數年。不同的亞型會表現出不同的臨床症狀，但也可能出現過渡型或重疊性表現。患者的受累程度會隨年齡的增長而不同。發病年齡越小，受累器官數量越多，病情也越嚴重。但隨著年齡的增長，病變會逐漸侷限，症狀也會減輕。
典型的症狀主要有以下幾個方面：
1、骨骼病變：幾乎所有的朗格漢斯細胞組織細胞增生症患者都會出現骨骼病變，病灶可以是單發或多發的。主要表現為溶骨性損害，但是骨質可以完全修復，不會留下痕跡。病變會導致區域性腫脹、疼痛，往往沒有發紅或發熱的症狀。輕微外傷後可能會導致骨折。頭顱骨病變最常見，其他的長骨、扁骨和骨盆也常受累。顱骨損害最初呈現為包塊，質地硬，後來會變軟，能感覺到波動感，最後形成缺損，與正常骨質分界清晰。如果頜骨受到損害，可能會導致齒齦腫脹、牙齒鬆動或脫落。乳突和中耳受到侵襲可能會導致耳流膿和感染，球后組織受累可能會導致突眼。
2、皮疹：這種疾病常見於1歲以下的嬰兒。皮疹多分佈於軀幹、頭頸部，四肢較少受累。初期呈現為紅色或棕黃色的斑丘疹，之後可能出現出血樣、溼疹樣或者脂溢性皮疹。而後就會形成結痂、脫屑，留下白斑或色素沉著。皮疹往往會以批發形式出現，不同期別的皮疹可能同時存在。
3、肝、脾、淋巴結腫大：肝臟受累時常伴有肝功能異常、黃疸、低蛋白血癥、凝血酶原時間延長等症狀，嚴重時甚至可能會出現肝衰竭的狀況。隨著皮疹的消退，腫大的肝臟、脾臟和淋巴結也會逐漸縮小。
4、肺部浸潤：肺部病變的症狀輕重不一，通常會表現為咳嗽、氣急，嚴重的話可能會出現呼吸困難甚至呼吸衰竭。此外，還可能併發肺大皰、氣胸、肺氣腫等疾病，並常合併反覆呼吸道感染。
除了上述典型的症狀，朗格漢斯細胞組織細胞增生症還可能出現淋巴結病變。淋巴結病變可以分為三種形式：一是單純的淋巴結病變，也就是淋巴結原發性嗜酸性粒細胞肉芽腫；二是伴隨病變的侷限性朗格漢斯細胞組織細胞增生症，常常伴有溶骨性病變或面板病變；三是全身彌散性病變的一部分。全身彌散性病變常常會累及頸部或腹股溝的孤立淋巴結，可能會出現區域性疼痛。單純淋巴結受累者的預後相對較好。