CT和核磁共振是否可以同時進行需要進行具體分析。平掃可以在同一天完成，而核磁共振則沒有任何危害。然而，如果患者需要進行CT增強掃描，建議將其與核磁共振掃描隔天進行。這是因為增強掃描需要向體內注射造影劑進行掃描，而造影劑會增加腎臟的負擔。如果將這兩個檢查同時進行，將會增加腎臟負擔。
平掃可以在同一天進行，因為平掃不需要將造影劑注入體內，而且核磁共振也沒有輻射。然而，增強掃描CT需要向體內注射含碘對比劑，而這種對比劑可能會引起過敏反應，例如頭暈和噁心等症狀。核磁共振需要注射含釓對比劑，儘管現在含釓類對比劑的副作用較少，但為了儘快排出體外，建議患者在檢查完成後多喝水，以促進排出。如果只進行平掃，CT和核磁共振可以在同一天進行。然而，如果需要進行增強掃描，則建議將其分開進行，不能在同一天進行。
對於某些患者，可以只進行CT檢查，例如腦出血患者，因為CT檢查快速、成本較低，已足以診斷病情。對於一些CT檢查結果正常的患者，醫生可能建議進行核磁共振複查，因為核磁共振對於腦梗塞非常敏感。在六小時內發生的腦梗塞在CT掃描中無法檢測出來，可能完全呈陰性。而核磁共振可以透過特殊序列，如DWI序列，清晰展示高訊號影像。因此，核磁共振具有獨特的優勢，可以檢測到六小時內發生的急性期梗塞情況。