先天性心臟病患者的壽命往往與病變的種類密切相關。
對於複雜的先天性心臟病病變,如單心室、永存動脈幹、大動脈轉位、右室雙出口等,患兒在出生後不到兩三歲可能會因此喪命。而患有法洛四聯症的兒童,往往因為缺氧而有猝死的風險,通常的壽命在十幾歲左右,有極少部分患者能夠活到二十多歲。患有房室管畸形和肺靜脈異位引流等病變的兒童,很快就會出現肺動脈高壓的情況,這會對患兒的壽命產生影響。
而對於較為簡單的先天性心臟病病變,如動脈導管未閉、房間隔缺損、室間隔缺損等,在臨床上成年患者較為常見。其中,有些患者能夠活到五十多歲,如房間隔缺損和室間隔缺損的患者,然而,由於已經失去手術的機會,這部分患者的生活質量會相對較差。