目前,世界衛生組織(WHO)認為宮頸癌疫苗沒有明顯的後遺症。但是,這種疫苗注射後會出現一些副作用。根據WHO的立場檔案,在全球接受了2億多針次的疫苗中,有些人注射後可能會在注射部位出現疼痛、紅腫、硬結等一些區域性症狀。雖然概率較高,但多數人在48小時內即可緩解,只有少數人可能會出現低熱,通常<38℃,也會在48小時內自行緩解。
至於該疫苗可能產生的遠期併發症,也就是後遺症,包括是否會影響生育、兒童的發育以及其他疾病,目前來看還沒有發現存在這些方面的影響。而且,WHO建議15歲之前的女性都接種宮頸癌疫苗,以此來防止疾病的發生。目前在歐美國家,十幾歲的女孩都能免費接種該疫苗,而這也沒有明顯的致畸作用。同時,在接種該疫苗後,女性也可以懷孕,接種疫苗並不影響生育。如果女性在接種期間意外懷孕,也不會建議流產,只需定期檢查即可。研究顯示,接種宮頸癌疫苗也不會增加免疫系統疾病的風險。