女性發燒腰疼可能由非疾病因素或疾病因素引起。非疾病因素髮燒時會導致肌肉產生無氧呼吸，生成大量乳酸，而乳酸堆積在肌肉內會引起腰痛和肌痛等症狀。患者可以透過區域性按摩或熱敷來緩解疼痛。
疾病因素方面，上呼吸道感染是由細菌或病毒感染引起的。這些細菌或病毒的繁殖刺激體溫調節中樞，導致發熱。發熱後可能伴隨全身痠痛或區域性疼痛等症狀。此外，病原體在體內生長繁殖，產生毒素刺激神經，引發肌肉和關節疼痛，伴隨打噴嚏、頭痛、流鼻涕、咳嗽、乏力等症狀。患者可在醫生指導下使用感冒清熱顆粒、對乙醯氨基酚片等藥物進行治療。
皮肌炎表現為累及面板和橫紋肌的自身免疫性結締組織病，主要症狀包括皮疹、肌肉壓痛和肌無力。微生物入侵體內會導致產生抗體，引發肌肉痠痛和發燒腰疼等情況。患者可以在醫生指導下使用潑尼松、甲氨蝶呤片等藥物治療。
橫紋肌溶解症是由物理、化學和生物因素引起的橫紋肌細胞損壞、崩解的情況。這會導致肌酸激酶、肌紅蛋白等細胞成分進入血液迴圈，引起機體內環境紊亂甚至急性腎功能衰竭等一系列症狀。橫紋肌分解和肌肉細胞內容物進入血液迴圈會導致發熱，引發腰部疼痛。患者可按醫生建議使用碳酸氫鈉等藥物治療。
除了上述原因外，盆腔炎、腎盂腎炎、腰椎間盤突出和腰肌勞損等疾病也可能在發熱時由於炎症刺激或症狀加重或復發而引發腰疼。患者可就診於醫院的普通內科，透過血常規等檢查明確診斷，並給予針對性的治療。