三歲嬰幼兒感染奧密克戎毒株後，臨床症狀並不典型，以發熱、咳嗽為主要表現，發熱程度各不相同。有時候還會伴有噁心、食慾不振、腹瀉等消化道症狀。在病程中，不同時期會表現出不同的症狀。
在疾病發病的第一天，嬰幼兒通常沒有特殊症狀。從第二天開始，會逐漸出現發熱和咳嗽。第三天是症狀最為嚴重的一天，體溫甚至可以達到39℃以上，伴有咳嗽、流涕、食慾下降等症狀。從第四天開始到第五天，體溫逐漸恢復正常，但咳嗽和流涕反而變得更加嚴重，食慾仍然不振。到了第六天，咳嗽和流涕會出現明顯改善，但這時候可能會出現胃腸道反應，如嘔吐、腹瀉等。第七天一般與第六天的症狀差不多，但相對輕微。
對於感染奧密克戎毒株的嬰幼兒，應特別關注體溫情況。由於神經系統發育尚不完善，高熱可能導致驚厥。另外，兒童屬於特殊人群，極少數兒童可能會出現出血中毒性休克綜合徵或巨噬細胞活化綜合徵，主要表現為發熱、皮疹、低血壓、凝血障礙甚至休克。一旦出現這種情況，病情可能會迅速惡化，應引起警惕。
如果三歲嬰幼兒感染奧密克戎毒株，應多次檢測生命體徵。一旦出現體溫再度升高、咳嗽加重等情況，應立即帶前往醫院就診，並透過CT、MRI等檢查明確病情，進行相應的處理。