早期診斷是成功治療急性骨髓炎的關鍵。治療過程分為三個部分。
第一部分是全身的支援治療。這包括加強全身營養，進行對症治療，如在高熱時進行降溫、補液、糾正酸中毒，並在必要時進行少量多次輸血。透過這些治療，可以增強患者的抵抗力，同時提供易於消化的富含蛋白質和維生素的飲食。
第二部分是抗菌藥物的應用。抗菌藥物應該是有效、聯合、足量並需要進行足夠時長的治療。如果在高燒時能夠透過血培養檢測出細菌，或者出現分泌物的情況，可以進行細菌培養。如果有培養結果，可以根據結果選擇合適的抗生素，這是最理想的情況。如果沒有培養結果，則只能依靠臨床經驗。一般而言，治療週期會較長，大約為4-7周。首先進行3周的靜脈輸液治療，然後變為口服治療3周，當體溫、白細胞計數、血沉率以及C-反應蛋白恢復正常，且症狀和體徵均消失後再停藥。需要注意的是，治療週期可能較長。同時，可以結閤中藥的口服和外用，如中藥骨炎通絡丸口服和骨炎膏外用。
第三部分是區域性治療。可以使用夾板、石膏或皮牽引進行固定。患肢應該被抬高並保持功能位。如果出現僵硬的情況，應該將其固定在功能位，以防止畸形和病理性骨折的發生，有利於炎症的消退。
如果經過2-3天的抗生素治療仍無法控制，就需要及時進行手術。手術主要包括鑽孔減壓或開窗減壓。