首先，結石患者需要保持充足的飲水量。對於沒有水量限制的疾病患者來說，每天的飲水量應當保證尿量不低於2000毫升，以降低尿液中溶質的濃度，避免結晶析出。楊波醫生指出，如果能夠獲得結石標本，透過檢測結石成分來制定針對性的飲食控制措施。對於草酸鈣結石患者而言，應避免食用富含草酸的食物，如番茄、菠菜、蘿蔔、芹菜、土豆、濃茶和巧克力等。而對於富含磷酸鹽的肉類、魚類和骨頭湯而言，應限制磷酸鈣和磷酸鎂銨結石患者的攝入。此外，尿酸是嘌呤的代謝產物，在動物內臟、海產品、花生和豆角中富含嘌呤。因此，胱氨酸結石患者應避免食用富含嘌呤的動物源食物。
其次，食物中的其他成分也會對結石形成起到重要作用。鈉抑制腎小管對鈣的重吸收，因此限制鈉的攝入量（即減少鹽的攝入）能夠增加鈣質的重吸收，有利於減少結石的形成。統計資料顯示，葷食者患結石的發病率比素食者高三分之一。楊波解釋道，檸檬酸鹽能夠抑制結石的形成，而動物性蛋白質會增加尿液中尿酸的分泌，從而降低尿液中檸檬酸的濃度；而素食者經常攝入富含鉀離子的水果和蔬菜，能夠增加尿液中檸檬酸鹽的分泌，降低結石的發病率。
此外，結石患者不宜攝入過多的糖。楊波提醒說，進食糖後尿液中的鈣離子濃度和草酸會增加，並增加尿液的酸度，酸性尿液使尿酸和草酸鈣更易沉澱，從而形成結石。另外，由於維生素C在代謝後的產物是草酸。因此每天攝入的維生素C量應不超過5克；濃茶或咖啡會增加尿液中草酸的濃度，但大量飲用清淡的咖啡或茶水則能夠起到利尿作用，對尿液中草酸濃度的影響不大，反而有利於預防結石的發生。