MRI（磁共振成像）和CT（計算機斷層掃描）是常用的醫學影像學檢查方法，兩者具有不同的成像原理和特點。
首先，兩者的成像原理有所區別。CT利用X線透過人體組織時的不同衰減程度進行掃描成像，而MRI則利用人體內氫原子核在磁場中共振發出訊號來進行成像。
其次，兩者對人體的輻射損傷也有差異。CT使用放射線會對人體產生輻射損傷，而MRI則使用電磁波，對人體沒有電離輻射損傷，相對較安全。
進一步，兩者的成像層面也存在差異。CT只能進行橫斷面成像，而MRI可以進行任意方位的成像。
此外，兩種方法在優勢檢查部位上也有所不同。CT在顯示肺部、骨骼和鈣化方面較為突出，而MRI在軟組織（如脂肪、半月板、軟骨、肌肉、韌帶等）、神經系統和脊髓的成像上效果更好。值得注意的是，MRI檢查存在禁忌症，不適合所有患者。
此外，CT在急診情況下的應用較為廣泛，可用於全身各個部位，特別適用於肺部病變、急性腦出血、外傷、骨腫瘤病變和鈣化等檢查。而MRI幾乎也能用於全身各個部位的掃描，對神經系統的病變尤其優於CT，如超急性腦梗死、腦腫瘤、腦炎等。
最後，兩者在檢查時間和費用方面也存在差異。CT的預約時間短、檢查時間短並且費用較低，而MRI的預約時間相對較長、檢查時間較長而且費用較高。
總的來說，MRI和CT具有本質的區別，兩者在臨床應用中相輔相成，彼此不能取代。醫生在選擇適當的檢查方法時應根據患者的臨床症狀和病史進行綜合判斷。