飲食手術6小時後，若無噁心、嘔吐症狀，可以開始進食流質飲食，並在術後第二天過渡至半流質飲食，第三天即可恢復正常飲食。術後的疼痛通常在手術當天至第一天出現，多數表現為不同程度的頸部切口痛感，特別是在吞嚥時明顯，但通常能夠耐受，隨著時間的推移，疼痛逐漸減輕，一般會在兩三天后消失。對於全麻手術的患者，術後3-5天可能會出現喉嚨痛和咳嗽。一般情況下，疼痛症狀會在術後3-5天自然消退，如疼痛症狀較為明顯，可向醫生諮詢用藥建議。甲狀腺手術的切口是無菌的，因此術後預防性抗生素使用通常不超過48小時，沒有必要長時間使用抗生素和靜脈輸液。如果因為體質虛弱、進食少或其他原因需要輸液，醫生會酌情進行補液。術後當日回到病房後，採用平臥位，6小時後可以轉為半臥位。術後48小時內要使用枕頭將頭部墊高。
一般情況下，術後一天可以坐起，若沒有不適感可進行離床活動。在改變體位時，頭頸部位置要相對固定，避免過度轉動頸部。根據頸部傷口的癒合情況，通常在術後6-7天開始進行活動。術後2周內避免舉重，不要過度後仰頸部。最好在術後1周內休息，若從事重體力勞動，建議休息2周。術後傷口可能會有輕度腫脹和發紅，這屬於正常情況，通常會在2周內消退。如果感到呼吸困難，應及時告知醫生。傷口縫線通常在5-7天后拆除，拆線前不要用溼毛巾擦拭傷口，拆線後2天可以用溫水輕柔清洗頸部。術後的2-3個月內，切口可能會產生僵硬感，這是正常的切口反應，後期會逐漸變軟。術後的複診時間和內容會根據患者具體情況而定，甲狀腺作為人體重要的內分泌器官，手術可能會對其功能產生暫時或永久性的影響。
結節性甲狀腺腫患者術後需要服用甲狀腺素製劑（優甲樂）1.5-2年，而甲狀腺癌患者則需要終身服藥。藥物的主要副作用有頭痛、心慌和高血壓。定期驗血以檢查甲狀腺功能，以免劑量過大引起藥物性甲亢，或劑量不足影響療效。只要劑量適當，長期服用甲狀腺素製劑不會對身體產生不良影響。在清晨起床後空腹服用甲狀腺素製劑，並在服藥後半小時左右進食早餐，這樣可使藥物的副作用最小化，療效最佳。同時，避免與治療胃病的藥物同時使用，以免影響藥效。