正頜聯合矯治是國際通用的治療頜骨發育畸形和獲得性畸形的基本方法。治療過程一般分為三個階段：先進行正畸，然後進行手術，最後再進行正畸。患者可以選擇掛號在正畸科或頜面外科就診，在完成檢查並準備好所有必要資料後，正畸科和頜面外科醫生會組織一箇聯合會診，制定出正畸和手術的基本方案，確定方案後開始正式的治療過程。術前的正畸時間較長，平均約為1年（根據病情的不同略有差異），而手術住院時間只需要約10至14天左右。一箇月後進入術後正畸階段，大約需要半年的時間，這是基本的治療方式。
有需求的患者不要將自己的牙頜面畸形與整形外科簡單混為一談，正頜聯合矯治的治療更為嚴謹。一般強調形態和功能的兼顧，其過程和治療程式與整形外科不同。
目前也有一種新的治療模式被一些正頜聯合矯治醫生商討並採用，即先進行手術後再進行正畸（Surgery First）。這種方式的主要目的是縮短治療時間。這種方法首先在臺北和韓國率先進行應用，但是美國和日本等國的同行們對此比較反對。目前來看，並不是所有患者都適合採用這種治療方式，它有適應證的限制，必須謹慎推行。比如，在雙頜前突的患者中，如果咬合關係良好、牙齒排列良好，也可以直接進行手術而省去術前正畸階段。但是是否能夠直接進行手術，需要經過醫生的仔細檢查和決定。然而，對於上頜前突的情況來說，如果沒有術前正畸，直接進行手術的話很難獲得理想的咬合和麵部形態。而對於更為複雜的不對稱畸形，更不能捨棄術前正畸。
向我諮詢的患者，請準備好X線片（全口曲面斷層片、頭影測量正、側位片）、石膏咬合模型，以及正、側面面部照片，以便我能夠為提供準確的判斷和建議。不要將正頜外科等同於整形外科，正頜外科的治療方案是嚴謹的。沒有檢查資料的診斷和建議都是不準確的。正畸是整個治療過程中不可替代的重要環節。要獲得良好的治療效果，必須由有經驗的正畸醫師進行治療，包括糾正牙齒的代償、整齊擁擠的牙齒、調整牙合曲線等。只有這樣，才能取得良好的效果。