重症肌無力是一種主要採用藥物治療和手術治療的疾病。在藥物治療方面,膽鹼酯酶抑製劑是最常用的一線藥物,可快速緩解大部分重症肌無力的症狀。此外,免疫抑製劑也可與膽鹼酯酶抑製劑聯合使用。糖皮質激素和其他非激素類的免疫抑製劑也可作為免疫製劑的一種,預防和減少重症肌無力復發起著重要作用。糖皮質激素主要透過口服的醋酸潑尼松和甲潑尼龍來改善症狀,70%至80%的患者症狀能夠明顯改善。針對補體和B細胞的靶向生物製劑已經透過美國食品及藥物監督管理局的批准,可用於臨床治療。
手術治療方面,主要採用胸腺切除的方法。對於胸腺瘤患者,早期胸腺切除是必要的。對於非胸腺瘤患者,若內科保守治療無效,則可考慮胸腺切除,一般緩解率高達6%至50%。此外,自體造血幹細胞移植作為一種新的治療方法,也是研究的方向之一。個別案例報告顯示,在藥物治療效果欠佳的重症肌無力患者中,自體造血幹細胞移植可能成為重要的治療手段。特別適用於難治性複發性重症肌無力的患者。