男性不育症是指夫婦婚後同居一年以上，性生活正常，未採取任何避孕措施，由於男方原因造成女方不孕的情況。為了進一步明確男性不育症的病因，需要進行必要的檢查。
首先，男科體檢由專業的男科醫生進行，透過瞭解男性性徵以及睪丸、附睪、精索靜脈、輸精管等是否存在發育異常，獲得男子生殖狀況的基本資料。
其次，透過精液分析，瞭解精液的量、顏色、PH值、精子濃度、活力、活動率、存活率、畸形率、有效精子數、液化狀態等指標，以評估男子的生育能力。
還需要進行陰囊彩超檢查，以探查睪丸體積、附睪是否有結節、精索靜脈是否有曲張及返流，以及是否存在鞘膜積液等，從形態學角度評估男子的生殖器官狀況。
此外，還需要進行生殖系統微生物檢查，以排除常見的引起生殖系統感染的病原微生物，包括支原體、衣原體、優生四項、艾滋病毒、梅毒螺旋體、乙型肝炎病毒等。
抗精子膜抗體（MAR）的檢測可作為篩查男性免疫性不育的原因。
精漿生化檢查可以瞭解精漿的PH值、白細胞、酸性磷酸酶、鋅、果糖、α-葡萄糖苷酶等指標，以評估男子附屬性腺的分泌功能及輸精管道通暢程度。
精漿彈性蛋白酶是隱匿型生殖道感染的診斷及愈後檢測指標，其可靠性得到了世界衛生組織的認可。
精子功能測定更能客觀地反映精子的受精能力，是對精液常規檢查的必要補充。頂體酶測定則主要評估精子穿過透明帶的能力。
精子DNA碎片率的檢測反應了精子DNA的損傷程度，是判斷特發性男性不育症、反覆流產、輔助生育及優生預後常用的指標。
性交後試驗可透過檢測判斷精子是否能穿透宮頸粘液，以及是否具有較好的受精能力。
在進行檢查時，需要注意保持最佳狀態：近2-3個月不吸菸、不酗酒、不過度勞累、無感冒發燒、無重大疾病，並於排精後的第3-5天（包括同房、遺精、自慰等），在正規醫院的生殖科專業取精室留取完整的精液標本，避免精液的灑落。