鹼性磷酸酶升高的原因是多方面的。首先,鹼性磷酸酶廣泛分佈於人體的肝臟、骨骼,肝、腎、胎盤等組織,並經肝臟分泌到體外。鹼性磷酸酶具有多種同工酶,因此它分佈在肝臟、骨細胞、胎盤、腫瘤細胞以及小腸的絨毛上皮或成纖維細胞等部位。因此,生理性增高是鹼性磷酸酶升高的常見原因之一。例如,在兒童生理性骨骼發育期,鹼性磷酸酶水平通常比正常人高1-2倍,而一些生長較快的兒童可能更高。青春期的青少年處於生長期,骨骼生長較快,也會導致鹼性磷酸酶升高。孕婦以及攝入脂肪含量較高的食物也會引起鹼性磷酸酶升高。
另外,鹼性磷酸酶的升高也可由病理因素引起。在骨科疾病中,佝僂病、軟骨病、骨骼原發的惡性腫瘤或骨轉移性腫瘤等均可導致鹼性磷酸酶升高。肝膽疾病如肛管腸管組塞、肝外膽管結石、肝管硬化、肝癌以及毛細膽管性肝炎,也會引起肝膽源性鹼性磷酸酶的升高。此外,甲狀旁腺功能亢進以及其他一些原因也可能導致鹼性磷酸酶的升高。