復發的橫紋肌肉瘤的預後並不樂觀，治療需要採用多種手段的綜合治療，有些情況下需要進行個體化治療方案，甚至聯合靶向治療和免疫治療。
影響預後的因素包括腫瘤復發部位、原發腫瘤治療結束到復發的時間間隔、是否給原發腫瘤進行過放療。因此，對胚胎性橫紋肌肉瘤完全緩解的患者仍需進行標準化的監測和隨訪，一旦出現復發情況，需要進行標準化的化療治療，以達到再次完全緩解的效果。如果患者初次診斷時，腫瘤發生在預後不良的部位，如膀胱、前列腺、肢體、腦膜、盆腔、會陰、肝臟等，而且無法完全切除，或者兒童初次診斷時腫瘤已經發生了遠處轉移，則復發的概率更高。常見的復發部位包括腫瘤的原發部位以及肺、骨、骨髓等轉移部位。
橫紋肌肉瘤是兒童最常見的軟組織肉瘤，它是由異常生長的早期肌肉細胞發展而來，可以發生在身體的各個部位。
根據組織學型別的不同，橫紋肌肉瘤分為胚胎性橫紋肌肉瘤、腺泡狀橫紋肌肉瘤和多形性或間變性橫紋肌肉瘤。胚胎性橫紋肌肉瘤佔所有橫紋肌肉瘤病例的57%，是最常見的橫紋肌肉瘤型別。胚胎性橫紋肌肉瘤的預後相對較好，但也存在復發的可能性。胚胎期橫紋肌肉瘤的復發通常發生在治療後的3年內，在達到5年無病生存的胚胎性橫紋肌肉瘤患者中，復發情況非常罕見。